地下施設に入る
村にたどり着くと疫病の感染者達がいるが、彼らはミュータントで敵として襲ってくる。
ミュータント達を倒した後は地下施設へと向かうのだが、入口ドアを開くにはパスワード:7768387を入力するかスキル:ハックを使う必要がある。
ただローズがパーティーにいる場合はこれらの作業をしなくてもローズが開けてくれる。
パスワードはレンジャー・シタデルの博物館にあるフィンスターの仮面を調べればわかる。
施設に入るとバッドステータス:疫病状態になり、カリスマが4、知性が2それぞれ低下する。
この状態のままヴァーガスに会うとレベルアップ時のポイントを失ってしまうため、必ず治療してからにすること。
ジャンと会って疫病を治すためには浄化装置を復旧する必要があることを聞いたらさらに下の階へと向かう。
ちなみにパーティーにローズがいるとジャンとの特殊イベントが発生し、高レベルのスキル:ハックでジャンを疫病にさせるとローズはジャン側になっての戦闘になる。
B2Fではスキル:知覚や警報解除、解体屋などを駆使してトラップに対処し、ミュータントを倒しながら進んでいく。
ロックのかかったドアをパスコード:47946で開いて次の部屋に入るとナイトテラーがいる。
箱と金庫のある部屋には通気口ダクトがあり、そのダクトを通って奥へと進む。
警報装置付きのドアはまず警報を解除してから開くこと。
一番奥となる南西側の部屋には浄化システムの端末があり、これを操作すると疫病が排除されてミュータント達が襲ってこなくなる。
B1Fのドアのロックされた部屋にたどり着いたらスキル:警報解除(か機械修理?)を使ってドアを開き、Dr.チデマンが求めていた癌の治療薬を回収、コンピュータをハッキングしてウェイストランド1のディスクも回収しておく(トロフィー:ルーツ探訪)。
ジャンの所に戻るとダーウィン村のことを秘密にしておいてほしいと頼まれ、承諾すると神秘の祠の場所が記されるほか村から出る時にピゼピ・ジョーレンを仲間にすることができる。
拒否するとジャンとミュータント達との戦闘になり、承諾しておきながらヴァーガスにダーウィン村のことを話した場合はピゼピ・ジョーレンがパーティーから外れて去っていく。